1、观察肛门及直肠指检，以排除痔疮、肛裂、瘘管，尤其对肛门管、直肠癌肿的诊断，对于便血病人此项检查应列为必查项目。
2、大便检查：细菌性痢疾、溃疡性结肠炎及阿米巴肠病，大便常规检查均可呈脓血便，但溃疡性结肠炎粪便反复培养无致病菌生长，而细菌性痢疾可培养出致病菌。阿米巴肠病患者，新鲜大便反复镜检可找到溶组织阿米巴滋养体或包囊。
3、血液检查：伤寒患者血培养可找到致病菌，白血病患者周围血检查可发现幼稚细胞，骨髓检查可确诊。血小板减少症周围血及骨髓检查均可发现血小板异常减少。
4、肛镜肛镜：是诊断直肠出血性病变的有效检查方法，如肛裂、溃疡或内痔，在便血时，肛镜应与结肠镜检查结合使用。
5、结肠镜检：查凡有便血而诊断不明均为结肠镜检查的重要适应证。因肠镜不仅可作出病因诊断、准确的定位诊断，且可对部分原因的出血进行治疗。
6、X线钡餐及钡剂灌肠检查：对于严重下消化道出血的病人，紧急钡灌检查并无意义，且所显示的肠道病变可能并非出血原因，因而很少用诊断。如果经钡剂灌肠发现可疑病变，应复查结肠镜并活检。气钡双重造影可提高阳性率。此外，钡剂灌肠检查对于门诊普查有价值。
7、选择性血管造影：持续严重的出血病人不能做上述检查或上述检查不能明确出血灶时，应及时做选择性血管造影。不仅可明确活动性出血部位，而且对小肠病变内镜不能抵达8、放射性核素扫描：如结肠镜检查未发现出血灶，可静脉注入标记的红细胞做腹部扫描。本法能初步确定出血部位，为进一步血管造影提供线索。如肠内血液排空较快时，则易出现假阳性结果。
9、无绳胶囊内镜：是应用一种医用相机，内有闪光装置及影像捕促系统，安置在直径11～26mm大小的胶囊内，由病人直接吞下，借助于胃肠道蠕动而向下推进，在胃肠道内进行自动拍摄，通过悬于病人腰间的接收传感器传送彩色图像至电脑中并贮存。胶囊内镜是一项无创性检查，检查时允许病人自由走动，无需住院。胶囊内镜检查的唯一绝对禁忌症是消化道梗阻。目前主要用于小肠疾病的诊断。
10、双气囊全小肠镜检查：可明确胃肠镜未能达到的部位，明确出血部位、性质同时可做活检及治疗。
11、手术探查以及术中肠镜检查：经各种检查仍不能明确出血原因而又有持续大出血者应考虑剖腹探查，并可考虑术中肠镜检查。不过术中肠镜检查的并发症发生率较高，主要是黏膜溃疡、穿孔和迟发性小肠缺血。